221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1556 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  100 
 
 		 154 aa  317  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  46.32 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  48.48 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  42.52 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.93 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  41.27 
 
 		 197 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.46 
 
 		 356 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  36.72 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 391 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  41.73 
 
 		 197 aa  94  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  36.64 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  40.62 
 
 		 198 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  40.94 
 
 		 198 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  37.5 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  36.15 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  37.5 
 
 		 253 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  37.5 
 
 		 253 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 370 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  39.1 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 412 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 401 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.66 
 
 		 378 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  37.5 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  34.04 
 
 		 313 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.5 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.03 
 
 		 364 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  34.33 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.37 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.03 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.09 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  36.22 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 411 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  29.93 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.08 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  33.85 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  42.22 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  31.67 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  34.96 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  31.3 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  31.25 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  31.67 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  32.03 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  30.47 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  30.63 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  30.63 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  28.83 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  31.76 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  24.68 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  34.57 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  30.85 
 
 		 2805 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  29.33 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  26.39 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  35.8 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  35.29 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  35.23 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  34.09 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  28.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  28.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  29.53 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  37.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  29.86 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  35.35 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  37.04 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  34.57 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  36.46 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  37.84 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  26.72 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  28.57 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  32.97 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  28.15 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  29.57 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  35.8 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  31.62 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0660  Ribonuclease H  35.06 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.489941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  32.53 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  34.62 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  28.05 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  36.59 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  34.07 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  34.15 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>