208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1437 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  100 
 
 		 134 aa  283  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  50.38 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  48.48 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  39.06 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  38.28 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  40.46 
 
 		 383 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  38.28 
 
 		 253 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  38.28 
 
 		 253 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  37.69 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  40.62 
 
 		 198 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 370 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.64 
 
 		 356 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  35.61 
 
 		 211 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  38.17 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  40.46 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 		 391 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.13 
 
 		 378 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.88 
 
 		 369 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 		 440 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.88 
 
 		 382 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.11 
 
 		 365 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.11 
 
 		 365 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.11 
 
 		 365 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  38.46 
 
 		 313 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  39.06 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 		 401 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.01 
 
 		 364 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  39.84 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  40.3 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  36.22 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  32.31 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.71 
 
 		 378 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  39.84 
 
 		 198 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.12 
 
 		 452 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 		 412 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  39.06 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 412 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 411 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  35.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  35.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.09 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  34.09 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  32.28 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  36.23 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  36.43 
 
 		 2805 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  33.33 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  29.82 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  29.82 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  46.05 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  31.4 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  30.7 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  31.9 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  31.9 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  32.48 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  34.38 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  30.83 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  32.05 
 
 		 376 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  37.5 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  35.29 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  43.21 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  31.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  29.85 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2969  Ribonuclease H  28.37 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113773  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  40 
 
 		 269 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  32.41 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  31.36 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  34.18 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  31.94 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  31.86 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  37.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  35.8 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  30.43 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  36.71 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  32.91 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  37.97 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  37.18 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  31.29 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  31.03 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  28.32 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  28.06 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  29.86 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 		 532 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  31.17 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  29.66 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  29.29 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  32.17 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  30.61 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  31.91 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>