More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2969 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1135  ribonuclease H  65.33 
 
 		 158 aa  196  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  61.22 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  57.33 
 
 		 159 aa  183  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  57.33 
 
 		 152 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  54.61 
 
 		 241 aa  167  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  57.14 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  51.3 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  51.28 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  50.31 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  52.63 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  52.63 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  53.57 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  52.9 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  50.34 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  49.02 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  52.52 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  52.74 
 
 		 245 aa  148  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  51.41 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  50.65 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  50.65 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  50.65 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  50.65 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  53.9 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  50.65 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  48.59 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  48.39 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  51.39 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  51.72 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  48.39 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  47.74 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  50.71 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  50.7 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  47.1 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  52.59 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  51.47 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  47.1 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  48.98 
 
 		 236 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  51.47 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  53.33 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  51.47 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  51.45 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  50.72 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  51.85 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  51.85 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.85 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  48.59 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  50 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0474  RNase H  51.06 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.357306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  46.98 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  51.09 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  44.23 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  46.31 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  50.75 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  50.75 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  49.28 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  52.55 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  49.64 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  45.52 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  48.2 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  52.59 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  52.55 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  50.74 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  45.52 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  50.74 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  45.52 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  45.52 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  47.33 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  48.55 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  47.14 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  48.59 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  46.81 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  46.81 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  52.21 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  45.07 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  47.83 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  49.26 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  47.65 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  50.74 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  46.1 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  45.77 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  50 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  47.52 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  45.77 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  47.52 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>