More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1135 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1135  ribonuclease H  100 
 
 		 158 aa  327  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  65.33 
 
 		 157 aa  196  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  55.7 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  55.03 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  53.02 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  56.94 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  54.97 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  51.63 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  52.78 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  49.68 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  49.68 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  49.35 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  50.66 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  47.4 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  49.02 
 
 		 241 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  51.3 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  48.37 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  48.37 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  48.37 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  48.37 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  49.02 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  46.75 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  46.5 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  47.71 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  47.83 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  47.1 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  47.3 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  47.3 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  47.3 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  47.3 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  47.3 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  48.39 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  46.75 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  46.5 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  48.63 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  44.59 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  45.33 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  46.62 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  46.48 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  47.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  44.59 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  43.33 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  43.33 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  43.33 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  43.95 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  46.31 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  45.39 
 
 		 245 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  43.31 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  47.59 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  45.75 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  44.44 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  46.41 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  44.74 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  47.14 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  47.14 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0474  RNase H  42.59 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.357306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  45.39 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  43.92 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  43.04 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  47.86 
 
 		 148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  48.91 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.91 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  43.24 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  48.18 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  48.18 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  46 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  41.22 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  45.26 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  48.18 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  46.81 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  41.89 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  46.81 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  46.81 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  46.81 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  45.07 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  47.1 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  47.3 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  41.03 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>