More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1143 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  96.75 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  87.01 
 
 		 154 aa  291  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  84.42 
 
 		 155 aa  281  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  82.47 
 
 		 154 aa  279  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  82.47 
 
 		 154 aa  279  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  82.47 
 
 		 154 aa  279  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  82.47 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  81.58 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  81.17 
 
 		 155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  74.03 
 
 		 156 aa  246  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  75.16 
 
 		 154 aa  246  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  75 
 
 		 154 aa  244  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  70.86 
 
 		 157 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  69.08 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  68.63 
 
 		 158 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  66.67 
 
 		 185 aa  228  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  67.97 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  68.21 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  68.63 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  69.54 
 
 		 156 aa  227  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  68.21 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  67.97 
 
 		 158 aa  226  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  67.76 
 
 		 156 aa  226  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  68.63 
 
 		 158 aa  226  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  67.55 
 
 		 156 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  67.55 
 
 		 156 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  67.55 
 
 		 156 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  67.55 
 
 		 156 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  67.11 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0474  RNase H  63.82 
 
 		 153 aa  222  1e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.357306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  66.89 
 
 		 159 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  66.45 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  64.71 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  62.99 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  65.97 
 
 		 151 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  67.83 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  70.15 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  69.34 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  66.2 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  69.12 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  69.85 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  65.03 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  69.12 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  64.79 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  65.73 
 
 		 148 aa  196  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  65.22 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  66.19 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  64.54 
 
 		 150 aa  193  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  65.69 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  65.41 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  64.49 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  65.47 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  65.41 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  65.41 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  62.41 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  65.44 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  64.96 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  64.23 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  64.23 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  66.17 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  64.23 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  66.17 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  65.41 
 
 		 148 aa  190  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  65.22 
 
 		 153 aa  190  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  61.54 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  61.54 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  66.18 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  64.23 
 
 		 148 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  64.49 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  66.18 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  64.49 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  64.66 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  64.66 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  64.66 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  64.54 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  59.6 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  64.49 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  62.68 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  65.67 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  59.21 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  60.71 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>