More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1906 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  100 
 
 		 241 aa  504  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  50.63 
 
 		 245 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  47.68 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  60.54 
 
 		 159 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  55.48 
 
 		 163 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  55.48 
 
 		 163 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  53.33 
 
 		 157 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  55.56 
 
 		 170 aa  178  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  53.29 
 
 		 157 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  53.64 
 
 		 154 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  54.97 
 
 		 159 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  53.25 
 
 		 158 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  54.61 
 
 		 157 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  49.02 
 
 		 156 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  51.01 
 
 		 156 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  53.29 
 
 		 158 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  51.9 
 
 		 161 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  50.66 
 
 		 156 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  53.64 
 
 		 151 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  48.67 
 
 		 158 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  51.41 
 
 		 145 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  47.33 
 
 		 158 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  50.67 
 
 		 156 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  46.67 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  47.3 
 
 		 161 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  48.37 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  47.33 
 
 		 158 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  51.09 
 
 		 155 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  46.1 
 
 		 158 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  52.86 
 
 		 159 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  47.97 
 
 		 156 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  49.33 
 
 		 153 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  42.29 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  50.36 
 
 		 147 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  43.98 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  50.36 
 
 		 147 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  50.36 
 
 		 147 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  50.36 
 
 		 147 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  47.33 
 
 		 156 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  48 
 
 		 173 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  47.33 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  48 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  48.67 
 
 		 156 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  46.67 
 
 		 156 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.59 
 
 		 147 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.59 
 
 		 147 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.57 
 
 		 148 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  47.92 
 
 		 147 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  47.65 
 
 		 154 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  47.65 
 
 		 154 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.57 
 
 		 148 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0474  RNase H  45.7 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.357306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  46.98 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  47.65 
 
 		 154 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  50 
 
 		 143 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  51.52 
 
 		 152 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  47.33 
 
 		 155 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  45.39 
 
 		 159 aa  148  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  51.02 
 
 		 154 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.85 
 
 		 148 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  49.64 
 
 		 152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  51.41 
 
 		 147 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  51.85 
 
 		 146 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.11 
 
 		 150 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  51.85 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  45.33 
 
 		 154 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1135  ribonuclease H  49.02 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  45.52 
 
 		 148 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  50.7 
 
 		 148 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  44.67 
 
 		 154 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  46.31 
 
 		 157 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>