More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4709 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  47.68 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  44.12 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  51.7 
 
 		 159 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  49.01 
 
 		 157 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  47.37 
 
 		 154 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  52 
 
 		 157 aa  159  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  51.41 
 
 		 145 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  49.26 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  51.68 
 
 		 159 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  48.57 
 
 		 146 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  49.64 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  45.45 
 
 		 156 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  48.72 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  48.72 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  48.7 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  53.9 
 
 		 159 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  48.34 
 
 		 158 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  50.33 
 
 		 154 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  49.67 
 
 		 154 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  48.08 
 
 		 156 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  48.08 
 
 		 158 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  47.4 
 
 		 158 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  49.67 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  48.99 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  46.75 
 
 		 158 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  48 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  47.44 
 
 		 158 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  46.15 
 
 		 153 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  48.05 
 
 		 161 aa  144  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  47.06 
 
 		 147 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  51.82 
 
 		 152 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  53.73 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  48.34 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  47.68 
 
 		 156 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  47.44 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  47.44 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  46.97 
 
 		 152 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  47.44 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  51.85 
 
 		 151 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  47.44 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  51.05 
 
 		 160 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  48.98 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  51.08 
 
 		 142 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  47.68 
 
 		 154 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  46.67 
 
 		 157 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  48 
 
 		 154 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  48.34 
 
 		 155 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  50 
 
 		 143 aa  141  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  46.71 
 
 		 159 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.77 
 
 		 145 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  47.68 
 
 		 156 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  52.99 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  52.99 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  52.99 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  50.72 
 
 		 146 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  49.28 
 
 		 143 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  53.33 
 
 		 160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  48.34 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  38.81 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  49.28 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 145 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  53.79 
 
 		 148 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  52.45 
 
 		 148 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  48.05 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  52.17 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  53.62 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  54.48 
 
 		 151 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  47.68 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  50.36 
 
 		 155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  49.63 
 
 		 154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  52.99 
 
 		 148 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  50.75 
 
 		 161 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  49.63 
 
 		 154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  52.99 
 
 		 148 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  47.33 
 
 		 153 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  50.37 
 
 		 154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  45.65 
 
 		 146 aa  139  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  45.59 
 
 		 145 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  46.85 
 
 		 156 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  50 
 
 		 159 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  46 
 
 		 154 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  48.61 
 
 		 147 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>