More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1616 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  64.79 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  67.63 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  58.5 
 
 		 159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  61.11 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  63.36 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  60.71 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  63.04 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  60.99 
 
 		 146 aa  190  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  59.86 
 
 		 146 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  60.28 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  58.45 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  58.87 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  59.86 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  56.83 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  56.85 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  55 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  51.39 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50.69 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  52.08 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  53.73 
 
 		 162 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  56.43 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  48.34 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  52.45 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  54.35 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  51.41 
 
 		 269 aa  157  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  53.19 
 
 		 161 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  54.48 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  50.71 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  51.09 
 
 		 241 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  50 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  51.43 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  51.72 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  53.9 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  53.57 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  50.72 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  54.93 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  53.62 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  51.77 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  53.62 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.24 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  50.69 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  48.28 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  50.36 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  53.19 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  50.7 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  53.28 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  50.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.86 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  50.35 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  49.32 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  53.73 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  51.82 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  55.56 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  53.73 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  53.24 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  50 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  50.72 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  49.26 
 
 		 236 aa  150  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  52.14 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  49.66 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  52.52 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  49.66 
 
 		 152 aa  150  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  51.41 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  48.63 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  52.17 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  51.05 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50.72 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  52.17 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  47.14 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  47.95 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  50.36 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  51.43 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  51.08 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  51.02 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.57 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.57 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  51.8 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  47.37 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  48.61 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  47.59 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  50.71 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  49.26 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  51.8 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>