More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0619 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  70 
 
 
153 aa  217  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  68.57 
 
 
146 aa  206  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  64.54 
 
 
145 aa  203  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  61.11 
 
 
155 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  63.12 
 
 
147 aa  201  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  65 
 
 
146 aa  201  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  63.57 
 
 
152 aa  200  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  64.29 
 
 
146 aa  199  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  60.93 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  62.86 
 
 
146 aa  197  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  64.29 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  64.08 
 
 
153 aa  191  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  59.57 
 
 
145 aa  186  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  60.28 
 
 
154 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  57.93 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  59.42 
 
 
157 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  57.24 
 
 
151 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  55.48 
 
 
153 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  54.05 
 
 
162 aa  173  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  52.67 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  55.48 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  55.86 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  59.15 
 
 
147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  54.3 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  57.25 
 
 
145 aa  170  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  53.42 
 
 
154 aa  170  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  56.34 
 
 
153 aa  169  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  54.48 
 
 
154 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  55.94 
 
 
147 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  53.79 
 
 
154 aa  167  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  53.79 
 
 
154 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  55.17 
 
 
149 aa  166  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  54.17 
 
 
158 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  53.52 
 
 
163 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  56.34 
 
 
156 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  52.78 
 
 
146 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  52.48 
 
 
147 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  54.11 
 
 
152 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  54.17 
 
 
155 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  53.79 
 
 
150 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  52.08 
 
 
148 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  53.47 
 
 
143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  54.17 
 
 
161 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  55.4 
 
 
150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  52.48 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  51.77 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  51.77 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.77 
 
 
147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.77 
 
 
147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  51.77 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  53.85 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  53.47 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.39 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  50.35 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  50.35 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.45 
 
 
150 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  53.15 
 
 
148 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  53.28 
 
 
156 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  53.79 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  56.03 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  55.24 
 
 
156 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  51.37 
 
 
148 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  54.48 
 
 
154 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  51.37 
 
 
148 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  53.38 
 
 
151 aa  159  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  53.38 
 
 
185 aa  159  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  51.37 
 
 
151 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  53.15 
 
 
170 aa  159  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  54.61 
 
 
164 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  51.39 
 
 
145 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  50.71 
 
 
145 aa  158  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  52.08 
 
 
145 aa  157  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  51.68 
 
 
157 aa  157  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  53.85 
 
 
158 aa  157  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  50.35 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  52.52 
 
 
152 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  52 
 
 
157 aa  157  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  51.72 
 
 
148 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  53.52 
 
 
147 aa  157  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  51.72 
 
 
148 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  51.33 
 
 
163 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  51.33 
 
 
163 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  52.11 
 
 
157 aa  156  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  55.71 
 
 
164 aa  156  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  51.72 
 
 
150 aa  155  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  52.48 
 
 
146 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  52.55 
 
 
241 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  51.08 
 
 
154 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  53.19 
 
 
149 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  54.68 
 
 
154 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  51.75 
 
 
160 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  52.05 
 
 
152 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  52.45 
 
 
153 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  50.34 
 
 
155 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>