More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2025 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  69.29 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  58.7 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  58.7 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  57.97 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  55.63 
 
 		 146 aa  175  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  56.03 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  50.69 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  57.46 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  48.25 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  52.55 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  47.26 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  51.85 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  51.43 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  51.11 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  50.36 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  52.59 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  49.28 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  51.85 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  51.85 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  48.57 
 
 		 158 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  51.09 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  50 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  52.63 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  52.63 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  49.29 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  47.86 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  49.65 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  52.21 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  50.72 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  48.3 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  47.3 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  50.35 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  51.72 
 
 		 158 aa  146  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  49.66 
 
 		 166 aa  146  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  44.59 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  48.15 
 
 		 163 aa  146  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  51.13 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  47.55 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  49.64 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  47.14 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  48.25 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  49.29 
 
 		 173 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  45.71 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.74 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  47.48 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  48.23 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  48.23 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  48.23 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  49.65 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  46.94 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  42.86 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  48.23 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  48.23 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  44.68 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.88 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  45.39 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.62 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.88 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  47.62 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  47.62 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  49.62 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  49.62 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  51.13 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  51.13 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  51.13 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  47.45 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  47.14 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  48.18 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  50.38 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  47.14 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  45.71 
 
 		 185 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  48.55 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  46.04 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  48.89 
 
 		 153 aa  141  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  49.64 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  46.43 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  52.63 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  50 
 
 		 236 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  47.86 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  46.04 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>