More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2939 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  100 
 
 		 163 aa  339  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  74.13 
 
 		 153 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  69.44 
 
 		 149 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  66.9 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  67.38 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  66.67 
 
 		 148 aa  207  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  64.83 
 
 		 152 aa  207  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  61.43 
 
 		 149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0935  ribonuclease H  68.75 
 
 		 152 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  56.94 
 
 		 148 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  57.93 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  59.44 
 
 		 153 aa  190  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  59.03 
 
 		 153 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  59.29 
 
 		 146 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  56.25 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  54.93 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  57.14 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  58.45 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  54.86 
 
 		 147 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  54.86 
 
 		 147 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  54.86 
 
 		 147 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  56.85 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  56.55 
 
 		 150 aa  183  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  58.16 
 
 		 162 aa  183  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  57.86 
 
 		 143 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  56.55 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  57.75 
 
 		 150 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  56.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  54.17 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  54.17 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  57.34 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  54.17 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  57.14 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  54.86 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  53.47 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  53.47 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  55.86 
 
 		 154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  57.45 
 
 		 147 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  55.71 
 
 		 154 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  56.74 
 
 		 154 aa  180  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  55.94 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  52.78 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  56.43 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  55.94 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  53.38 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  56.83 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  56.83 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  56.83 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  54.61 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  57.55 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  58.87 
 
 		 152 aa  178  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  54.79 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  55.24 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  57.75 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  55.24 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  58.09 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  55.88 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  55.32 
 
 		 151 aa  177  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  54.48 
 
 		 148 aa  177  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  57.35 
 
 		 154 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  55.22 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  55.15 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  53.19 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  54.48 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  55.4 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  56.55 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  55.88 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  56.93 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  53.85 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  56.03 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  52.78 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  55.4 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  55.15 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  55 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  53.38 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  55.15 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  54.41 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  54.41 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  54.41 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  54.41 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  57.35 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.9 
 
 		 154 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  53.68 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  54.41 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  55.88 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  56.62 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  53.68 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  53.59 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  53.74 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>