More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2924 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  58.04 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  54 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  48.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  56.93 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  54.93 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  53.33 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  52.05 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  52.45 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  54.74 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  54.61 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  53.47 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  54.01 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  54.01 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.52 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  49.01 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  53.52 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  53.74 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  53.47 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  53.19 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  52.08 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  54.01 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  53.69 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  51.41 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  55.8 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  54.07 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  54.07 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  50.65 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  50.64 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  53.57 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  52.74 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  50.71 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  57.04 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  52.14 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  52.03 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  52.9 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  55.47 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  52.55 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  46.45 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  52.48 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  52.59 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  51.37 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  55.15 
 
 		 170 aa  150  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  54.01 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  51.43 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  54.01 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  55.88 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  47.62 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  53.02 
 
 		 236 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  54.07 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  54.48 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  54.01 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  52 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  52.55 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  52.48 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  50 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  54.48 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  54.48 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  47.3 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  47.3 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  52.05 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  51.37 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  52.45 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  47.55 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.24 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  49.65 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  47.1 
 
 		 175 aa  146  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  53.73 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  51.37 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  49.31 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  49.3 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  50.35 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  52.86 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  48 
 
 		 241 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  50.37 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  52.41 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  53.57 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  51.05 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  49.29 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  51.43 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  50.36 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  50.36 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  51.49 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  51.49 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  50 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>