More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2066 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  100 
 
 		 149 aa  312  8e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  64.58 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  56.76 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  56.76 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1743  ribonuclease H  66.21 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  55.48 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  55.48 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  55.78 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  57.24 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  53.57 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  50.69 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  54.23 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  50.69 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  50.69 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  48.23 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  156  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  156  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  45.95 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  44.97 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  50 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.74 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  47.52 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  49.31 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.26 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  43.92 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.45 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  52.45 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  51.03 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  47.22 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  44.3 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  42.95 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  42.95 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  42.95 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  42.95 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  47.83 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  47.52 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  44.22 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  43.24 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  43.24 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  43.62 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  44.76 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  48.94 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  45.64 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  44.97 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  41.89 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  43.92 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  48.53 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  47.41 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  47.86 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  47.83 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  46.53 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  46.48 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  45.39 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  44.29 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  46.43 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  43.26 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  44.68 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  46.43 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  47.79 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  44.59 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  44.44 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  46.15 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  46.67 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  46.32 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  45.32 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  44.22 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  44.52 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  47.06 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  46.32 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  47.18 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  47.62 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  43.06 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  41.89 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  45.39 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  46.76 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  46.76 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  45.71 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  46.43 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  47.55 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  48.25 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  45.59 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>