More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1743 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1743  ribonuclease H  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  71.03 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  65.19 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  59.85 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  59.85 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  59.71 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  58.39 
 
 		 146 aa  176  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  54.68 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  56.12 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  54.61 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  48.97 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  52.86 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.55 
 
 		 162 aa  151  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  47.95 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  52.41 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  54.86 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  51.06 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.45 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  51.43 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  51.09 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  51.82 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  48.53 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  50.37 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  49.32 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  50.71 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  47.86 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  49.26 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  47.65 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  48.18 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  45.71 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  49.28 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  46.15 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  46.43 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  45.14 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  45.52 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  49.29 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  45.83 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0474  RNase H  47.48 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.357306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  49.3 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  47.14 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  50.38 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  47.14 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.53 
 
 		 148 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  48.51 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  46.72 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  49.64 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  47.89 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  52.55 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  45.71 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  47.01 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  47.79 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  46.81 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  48.92 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  45 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  43.38 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  45.26 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  46.43 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  46.43 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  47.45 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  46.43 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  46.43 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  45.99 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  46.27 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  45.11 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  46.76 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  46.1 
 
 		 150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  45.39 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  48.59 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  44.44 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  42.36 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  46.76 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  46.04 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  47.26 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  45.77 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  45.14 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>