More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0409 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  100 
 
 		 155 aa  322  9e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  68.71 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  68.71 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  69.86 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  68.75 
 
 		 162 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  62.34 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  61.84 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  60 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  63.89 
 
 		 153 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  64.34 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  64.58 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  63.7 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  59.86 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  63.64 
 
 		 150 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  63.89 
 
 		 151 aa  200  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  64.54 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  64.54 
 
 		 151 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  61.11 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  62.77 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  59.72 
 
 		 148 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  61.64 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  59.72 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  59.72 
 
 		 148 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  60.71 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  60.71 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  60.71 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  61.27 
 
 		 148 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  61.27 
 
 		 148 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  62.07 
 
 		 148 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  62.07 
 
 		 148 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  60.71 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  61.27 
 
 		 164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  60 
 
 		 147 aa  187  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  60.54 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  61.15 
 
 		 155 aa  186  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  59.86 
 
 		 163 aa  186  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  60.87 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  62.32 
 
 		 154 aa  186  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  59.86 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  58.9 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  57.93 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  60.71 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  59.57 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  58.62 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  59.03 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  58.62 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  60.14 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  59.29 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  60.71 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  56.85 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  61.31 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  60 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  59.29 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  61.59 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  60.87 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  58.57 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  58.57 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  58.7 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  55.63 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  59.86 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  60.58 
 
 		 145 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  58.9 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  58.7 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  58.27 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  59.42 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  59.42 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  60 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  60.84 
 
 		 149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  59.42 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  56.46 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  57.55 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  59.44 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  55.86 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  59.15 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  55.86 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  59.71 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  58.87 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  58.99 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  59.15 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  57.75 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  60.28 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  58.87 
 
 		 148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  60.28 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>