More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1976 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  69.29 
 
 		 143 aa  207  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  55.78 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  51.45 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  51.45 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  50.72 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  53.33 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  52.59 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  49.65 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  50.37 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  51.11 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  50.35 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  51.8 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  50.7 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  50.68 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.82 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  48.57 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  51.45 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  50.71 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  46.58 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  53.73 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  45.89 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  52.17 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  45.89 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  45.52 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  48.92 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  47.62 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  43.97 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  48.94 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  49.29 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  47.86 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0935  ribonuclease H  47.59 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  46.81 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  46.04 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  47.14 
 
 		 154 aa  139  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  49.64 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  47.14 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  48.55 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  49.64 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  47.14 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0660  Ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.489941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  47.83 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  49.64 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  43.75 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  48.57 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  46.38 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  49.29 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  48.55 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  46.43 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  46.43 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  44.83 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  48.53 
 
 		 484 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  48.87 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  46.26 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  45.07 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  44.9 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  47.86 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  48.28 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  45.39 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  47.86 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  47.86 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  47.86 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  47.41 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  49.26 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  45.45 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  49.26 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  45.1 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  47.48 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  48.95 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  47.52 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  48.92 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1455  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1743  ribonuclease H  56.12 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  46.43 
 
 		 158 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  51.13 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  44.68 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>