More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0246 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  53.96 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  53.24 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  53.57 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  54.74 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  51.7 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  54.29 
 
 		 154 aa  166  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  54.01 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  53.19 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  53.24 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  51.82 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  54.17 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  52.55 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  53.1 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  51.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  53.1 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  51.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  51.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  52.21 
 
 		 161 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  50.36 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  52.08 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50.69 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  51.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  51.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.1 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  51.43 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  51.8 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  51.8 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  51.8 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  52.08 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  51.09 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  50.68 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  49.64 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  48.51 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  49.65 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  53.33 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  52.63 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  52.63 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  51.88 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  51.77 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  48.28 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  50.69 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  50.71 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  49.25 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  50.34 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  47.14 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  51.47 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  50 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  51.41 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  49.65 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  48.92 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  49.26 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.47 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.26 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  50.74 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  48.3 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  49.64 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  50.37 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  49.64 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  47.14 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  50.7 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  51.49 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  51.49 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  51.13 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  49.3 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  49.3 
 
 		 175 aa  147  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.53 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.53 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  49.29 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  49.62 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  49.62 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  48.92 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  48.92 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  44.52 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  50 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  48.59 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  48.59 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  50.38 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  46.48 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>