More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1754 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  74.48 
 
 		 147 aa  233  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  64.79 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  65.19 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  61.97 
 
 		 153 aa  196  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  61.11 
 
 		 146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  61.11 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  60.14 
 
 		 146 aa  190  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  63.38 
 
 		 145 aa  189  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  60.14 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  61.54 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  60.42 
 
 		 152 aa  184  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  52.82 
 
 		 159 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  55.86 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  56.64 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  53.15 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  53.96 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  56.3 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  50.68 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  51.43 
 
 		 163 aa  156  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  53.62 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  53.28 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  53.28 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0706  ribonuclease H  51.75 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.572232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  51.41 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  50.71 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  149  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.55 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  51.8 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  49.64 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  51.82 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  48.95 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  52.59 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  51.47 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  54.93 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  52.52 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  51.08 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  48.2 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  48.97 
 
 		 269 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  50.71 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  49.66 
 
 		 164 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  50.36 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  49.65 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  49.28 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  48.23 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  52.55 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  48.23 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  50.71 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  48.57 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  47.41 
 
 		 241 aa  143  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  53.38 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.82 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  49.64 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  48.23 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  48.95 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  48.18 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  51.09 
 
 		 156 aa  141  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  49.28 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  48.59 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  51.49 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  50.36 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  47.89 
 
 		 163 aa  140  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  51.82 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  51.82 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  51.82 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  51.82 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  51.82 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.36 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  52.94 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  48.95 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  50.37 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  50.36 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  46.94 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.64 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  49.3 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  48.53 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  47.48 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  47.86 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  45.59 
 
 		 236 aa  138  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  50.72 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  51.49 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  52.24 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>