More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0446 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  100 
 
 		 145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  59.86 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  60.87 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  59.71 
 
 		 146 aa  174  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  57.86 
 
 		 153 aa  173  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  56.83 
 
 		 152 aa  170  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  57.14 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  55.63 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  54.29 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  55.32 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  55.47 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  56.06 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  52.41 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  51.41 
 
 		 241 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  54.29 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  52.9 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  55.07 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  55.07 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  50.71 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  55.71 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  53.52 
 
 		 170 aa  155  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  53.62 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  56.52 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  55.8 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  54.35 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  54.93 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  55.56 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  55.56 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  54.93 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  52.17 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  51.45 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  51.41 
 
 		 236 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  54.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  52.45 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  52.78 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  52.45 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  52.45 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  54.35 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  56.3 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  54.29 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  55.8 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  51.75 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  55.07 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  54.35 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  51.75 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  53.62 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  51.75 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  51.05 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  51.05 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  51.05 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  51.75 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  50.72 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.9 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  50 
 
 		 245 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  51.08 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  53.62 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  52.14 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  53.62 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  54.35 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  54.93 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  52.9 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  54.55 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  54.23 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.05 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.05 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  50 
 
 		 269 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  51.43 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  51.05 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  49.65 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  52.17 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  51.09 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  53.33 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  51.08 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  51.41 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  51.41 
 
 		 170 aa  144  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  53.28 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  52.45 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  51.43 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  52.45 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.25 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.25 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  50.69 
 
 		 156 aa  143  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  143  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  54.01 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  53.28 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  52.55 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>