More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1837 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  64.44 
 
 		 152 aa  184  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  57.86 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  57.86 
 
 		 145 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  55 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  57.86 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  55.71 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  52.82 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  56.43 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  56.64 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  56.83 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  53.57 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  51.39 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  51.02 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  50.7 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  50.68 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  51.77 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  51.39 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  51.37 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  48.61 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  48.18 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  50.35 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  50.69 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  45.21 
 
 		 269 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  49.65 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  48.59 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  50.36 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  47.92 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  49.66 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  51.08 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  48.99 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  47.62 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  48.03 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  47.59 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  47.92 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  51.06 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  48.61 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  51.45 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  48.61 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  49.66 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  48.32 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  48.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  48.59 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  46.98 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  48.97 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.55 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.2 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  48.18 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  47.65 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  48.53 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  52.48 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  48.57 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  48.32 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  45.27 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  47.65 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  46.81 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  47.48 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  48.92 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  46.81 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  46.31 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  47.18 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  49.26 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  47.22 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  47.1 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  46.76 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  47.14 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  47.06 
 
 		 236 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  43.8 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  47.1 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  42.96 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  47.65 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  46.48 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  47.48 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  46.36 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  46.48 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  43.57 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  47.86 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  47.86 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  46.67 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  48.61 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  48.23 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  45.71 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  46.58 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  49.29 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  43.62 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  47.3 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>