More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2115 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  59.71 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  57.04 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  55.63 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  55.94 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  55.94 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  55.24 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  57.35 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  54.55 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  54.23 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  56.64 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  53.85 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  55.32 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  50.7 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  53.15 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  56.43 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  54.23 
 
 		 269 aa  155  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  53.1 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  53.1 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  51.75 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  49.66 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  52.82 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  50.36 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  50.69 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  52.05 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  51.77 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  51.41 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  52.41 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50.7 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  51.03 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  51.77 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50.34 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  50 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  53.19 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  49.66 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  51.06 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  48.95 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  49.65 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  49.3 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  51.03 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  48.28 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  47.92 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  51.03 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  54.48 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  49.64 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  50.34 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  48.59 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  50.35 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  48.97 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  48.23 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  49.66 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  51.03 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  48.25 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  47.83 
 
 		 159 aa  140  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  51.45 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  48.57 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  48.57 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50.35 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  50.7 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  49.65 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  49.65 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  51.41 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  49.65 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  47.18 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  51.8 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  52.86 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  47.92 
 
 		 170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  47.55 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  48.92 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.95 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  46.21 
 
 		 164 aa  136  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  45.77 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  52.48 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  47.65 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  47.18 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  49.32 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  46.43 
 
 		 241 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  48.2 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  50.7 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  48.53 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  48.97 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  47.89 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.97 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  46.85 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  49.65 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  47.92 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  49.3 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  49.32 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>