60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3014 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  79.86 
 
 		 149 aa  221  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  51.91 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  38.97 
 
 		 363 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.88 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  39.85 
 
 		 391 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  40.46 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  36.84 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  36.84 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  36.09 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  39.85 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.16 
 
 		 452 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.84 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 440 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  36.09 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.17 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.17 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.17 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  36.8 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.51 
 
 		 378 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.71 
 
 		 378 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.66 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.51 
 
 		 427 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.6 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  37.12 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  30 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  33.85 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.13 
 
 		 364 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 411 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  34.55 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.13 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  36.22 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  30.83 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  34.38 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  26.72 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  33.06 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  36.36 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  29.85 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  35.16 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  30.5 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  32.8 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  28.57 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  33.33 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  40.98 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  32.54 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  29.01 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  32.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  27.27 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  27.82 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  31.58 
 
 		 152 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  33.61 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  38.2 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>