13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37130 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37130  predicted protein  100 
 
 
459 aa  956    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  36.36 
 
 
126 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  32.5 
 
 
253 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  32.5 
 
 
253 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  31.3 
 
 
254 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  31.67 
 
 
168 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  36.62 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  37.18 
 
 
187 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  29.57 
 
 
197 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  32.89 
 
 
187 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  28.7 
 
 
198 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>