50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1923 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1509  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.600334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  36.21 
 
 		 253 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  36.21 
 
 		 253 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  35.34 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  31.36 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  29.2 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  30.09 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.65 
 
 		 369 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  36.84 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.93 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.93 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.93 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  35.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  29.46 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  37.93 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  32.74 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.88 
 
 		 383 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  29.6 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  32.59 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  31.86 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  29.57 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  29.1 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.17 
 
 		 364 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  27.03 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  27.03 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.43 
 
 		 356 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  31.71 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  33.07 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  32.26 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  25.23 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  36.28 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  25.23 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  30.89 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  32.74 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 370 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.48 
 
 		 378 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 363 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  23.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  30.51 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.61 
 
 		 378 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  25.24 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>