More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3313 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  68.15 
 
 		 259 aa  221  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  67.33 
 
 		 302 aa  205  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  68 
 
 		 302 aa  201  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  58.04 
 
 		 247 aa  173  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  58.74 
 
 		 252 aa  173  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  55.56 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  55.56 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  58.7 
 
 		 257 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  60.74 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  56.85 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  58.7 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.67 
 
 		 532 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  59.26 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  50.35 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 527 aa  157  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  57.14 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  55.24 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  54.61 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  59.7 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  59.56 
 
 		 155 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  55.15 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  58.7 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  58.82 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  56.72 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  56.72 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  58.82 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  57.46 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  55.88 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  53.9 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  54.81 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  54.01 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  52.48 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  54.81 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  57.78 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  51.7 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  57.78 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  57.04 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  52 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  51.05 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  52.82 
 
 		 148 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  54.23 
 
 		 148 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  52.82 
 
 		 148 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  55.56 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  55.8 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  55.97 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  55.56 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  57.25 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  55.88 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  58.09 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  53.02 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  52.48 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  56.3 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  52.48 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  54.01 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  51.02 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  57.25 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  56.62 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  55.94 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  50 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  50.68 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  51.41 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  56.93 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  53.96 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  52.86 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  54.07 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  53.96 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  52.45 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  55.56 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  49.65 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  47.02 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  55.97 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  47.02 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  47.02 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  47.02 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  52.9 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.06 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  55.47 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  53.57 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  50.72 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  50.67 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  53.57 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  54.07 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>