More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0428 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  75.5 
 
 
302 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  51.04 
 
 
259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  67.33 
 
 
157 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  34.66 
 
 
247 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  35.79 
 
 
257 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  33.1 
 
 
252 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  46.45 
 
 
161 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  46.45 
 
 
161 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  51.05 
 
 
160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  52.55 
 
 
154 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  46.48 
 
 
163 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  48.65 
 
 
149 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  45.58 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  48.57 
 
 
142 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  51.82 
 
 
154 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  50.7 
 
 
153 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  41.81 
 
 
223 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  50.72 
 
 
161 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  51.11 
 
 
225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50.72 
 
 
150 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4615  hypothetical protein  81.01 
 
 
91 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0227582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  46.98 
 
 
157 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  46.32 
 
 
163 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50.37 
 
 
148 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  49.63 
 
 
223 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50.37 
 
 
148 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  50 
 
 
238 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  47.14 
 
 
151 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  48.63 
 
 
228 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  48.89 
 
 
160 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  48.63 
 
 
228 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  47.86 
 
 
155 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  46.62 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  48.55 
 
 
155 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.01 
 
 
532 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  45.21 
 
 
156 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  46.53 
 
 
153 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  47.01 
 
 
527 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  50.69 
 
 
156 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  47.86 
 
 
155 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  46.72 
 
 
154 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  45.26 
 
 
162 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  44.44 
 
 
149 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  44.97 
 
 
156 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  44.97 
 
 
156 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  44.97 
 
 
156 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  43.51 
 
 
150 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  44.97 
 
 
156 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  45.99 
 
 
151 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  48.53 
 
 
153 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  48.2 
 
 
153 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  49.64 
 
 
150 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  47.52 
 
 
150 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02291  ribonuclease HI  35.23 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.818783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  48.15 
 
 
148 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  45.64 
 
 
157 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  47.22 
 
 
156 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  43.15 
 
 
166 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  49.29 
 
 
157 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  49.63 
 
 
147 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  45.89 
 
 
148 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  46.76 
 
 
143 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  47.83 
 
 
153 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  47.18 
 
 
156 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  47.18 
 
 
175 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  47.1 
 
 
150 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  44.85 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  48.51 
 
 
146 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  48.89 
 
 
150 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  46.38 
 
 
150 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  47.1 
 
 
149 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  47.1 
 
 
148 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  45 
 
 
147 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  47.41 
 
 
148 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  47.41 
 
 
148 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  45.45 
 
 
185 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  47.1 
 
 
148 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  48.89 
 
 
150 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  47.1 
 
 
148 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  43.75 
 
 
235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  46.85 
 
 
157 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  46.72 
 
 
161 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  45.32 
 
 
155 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  47.41 
 
 
148 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  44 
 
 
154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  46.04 
 
 
154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  46.72 
 
 
159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  46.48 
 
 
151 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  45.27 
 
 
154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  45.32 
 
 
154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  48.18 
 
 
150 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>