More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2435 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  65.22 
 
 		 170 aa  195  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  65.22 
 
 		 157 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  63.24 
 
 		 141 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  60.14 
 
 		 148 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  59.44 
 
 		 160 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  59.44 
 
 		 148 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  60.71 
 
 		 146 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  58.74 
 
 		 147 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  60 
 
 		 149 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  58.04 
 
 		 147 aa  177  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  57.34 
 
 		 147 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  57.34 
 
 		 147 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  61.87 
 
 		 160 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  57.34 
 
 		 147 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  59.15 
 
 		 148 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  58.67 
 
 		 151 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  59.15 
 
 		 148 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  57.34 
 
 		 147 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  57.34 
 
 		 148 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  59.31 
 
 		 149 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  60.71 
 
 		 148 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  57.34 
 
 		 147 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  57.93 
 
 		 159 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  60.71 
 
 		 148 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  57.14 
 
 		 161 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  57.14 
 
 		 162 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  57.97 
 
 		 175 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  56.85 
 
 		 148 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  59.56 
 
 		 142 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  56.85 
 
 		 148 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  57.14 
 
 		 149 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  56.43 
 
 		 153 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  57.14 
 
 		 148 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  56.83 
 
 		 153 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  56.52 
 
 		 148 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  56.52 
 
 		 148 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  58.45 
 
 		 157 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  58.57 
 
 		 145 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  56.52 
 
 		 148 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  56.12 
 
 		 147 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  57.97 
 
 		 150 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  55.24 
 
 		 148 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  54.73 
 
 		 151 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  57.64 
 
 		 150 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  55.7 
 
 		 155 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  57.14 
 
 		 149 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  57.97 
 
 		 150 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  55.8 
 
 		 148 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  53.29 
 
 		 154 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  55.19 
 
 		 157 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  56.94 
 
 		 154 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  55.71 
 
 		 151 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  58.09 
 
 		 142 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  57.86 
 
 		 145 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  55.7 
 
 		 152 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  54.86 
 
 		 154 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  57.64 
 
 		 185 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  54.17 
 
 		 148 aa  167  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  56.43 
 
 		 154 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  56.64 
 
 		 148 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  56.43 
 
 		 154 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  56.34 
 
 		 155 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  55.71 
 
 		 151 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  56.83 
 
 		 152 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50.99 
 
 		 153 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  55.24 
 
 		 163 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  57.78 
 
 		 159 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  56.43 
 
 		 154 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  56.12 
 
 		 151 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  53.74 
 
 		 149 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  53.9 
 
 		 147 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  54.41 
 
 		 164 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  54.23 
 
 		 153 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  52.48 
 
 		 150 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  54.93 
 
 		 154 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  54.48 
 
 		 153 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  53.57 
 
 		 151 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  56.12 
 
 		 154 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  54.29 
 
 		 145 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  54.68 
 
 		 154 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  50.32 
 
 		 156 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  58.45 
 
 		 157 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  50.7 
 
 		 155 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  52.17 
 
 		 143 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  53.57 
 
 		 150 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  53.1 
 
 		 146 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  54.35 
 
 		 153 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  57.04 
 
 		 150 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 154 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  159  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  54.68 
 
 		 166 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  55.07 
 
 		 161 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>