More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2115 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  57.66 
 
 		 154 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  56.74 
 
 		 155 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  57.78 
 
 		 154 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  52.15 
 
 		 154 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  59.29 
 
 		 157 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  57.25 
 
 		 151 aa  168  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  59.29 
 
 		 151 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  52.98 
 
 		 160 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  56.83 
 
 		 150 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  59.29 
 
 		 151 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  55.32 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  58.04 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  55.84 
 
 		 157 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  57.34 
 
 		 157 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  51.85 
 
 		 527 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.94 
 
 		 532 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  57.97 
 
 		 153 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  56.12 
 
 		 153 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  57.04 
 
 		 151 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  56.12 
 
 		 155 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  55.24 
 
 		 149 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  56.08 
 
 		 154 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  51.03 
 
 		 152 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  53.15 
 
 		 160 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  54.86 
 
 		 151 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  57.55 
 
 		 155 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  50.66 
 
 		 166 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  56.62 
 
 		 149 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  52.67 
 
 		 150 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  54.55 
 
 		 151 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  56.2 
 
 		 157 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  55.47 
 
 		 150 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  54.74 
 
 		 147 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  54.74 
 
 		 147 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  54.74 
 
 		 147 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  55.47 
 
 		 146 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  55.47 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  54.01 
 
 		 147 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  54.01 
 
 		 147 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  54.01 
 
 		 147 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  54.74 
 
 		 147 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  56.52 
 
 		 155 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  50 
 
 		 158 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  55.07 
 
 		 155 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  51.09 
 
 		 159 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  54.74 
 
 		 154 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  55.17 
 
 		 146 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  51.43 
 
 		 147 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  54.74 
 
 		 155 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  53.28 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  52.52 
 
 		 163 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  51.97 
 
 		 154 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  54.01 
 
 		 148 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  53.79 
 
 		 142 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  53.28 
 
 		 148 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  53.28 
 
 		 154 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  56.72 
 
 		 154 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  56.72 
 
 		 154 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  55.07 
 
 		 155 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  51.75 
 
 		 147 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50.68 
 
 		 153 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  53.33 
 
 		 154 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  53.33 
 
 		 154 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  53.33 
 
 		 154 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  51.43 
 
 		 163 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  53.68 
 
 		 158 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  53.68 
 
 		 156 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  52.55 
 
 		 156 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  53.68 
 
 		 156 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  53.68 
 
 		 156 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  53.68 
 
 		 156 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  53.68 
 
 		 158 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  53.68 
 
 		 156 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  52.45 
 
 		 154 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  54.74 
 
 		 173 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  52.9 
 
 		 152 aa  151  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  54.01 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  51.41 
 
 		 164 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  51.45 
 
 		 145 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  51.09 
 
 		 161 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  54.48 
 
 		 162 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  51.77 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>