More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0833 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 527 aa  1097    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  83.96 
 
 		 532 aa  924    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.95 
 
 		 237 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.62 
 
 		 241 aa  209  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  48.11 
 
 		 244 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  52.69 
 
 		 244 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  48.56 
 
 		 240 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  53.11 
 
 		 244 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  47.64 
 
 		 244 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.19 
 
 		 243 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  49.5 
 
 		 242 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 242 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.7 
 
 		 236 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  48.72 
 
 		 252 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.73 
 
 		 235 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  48.34 
 
 		 249 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.07 
 
 		 239 aa  200  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.48 
 
 		 237 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  52.54 
 
 		 244 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  52.54 
 
 		 244 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.62 
 
 		 237 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.11 
 
 		 232 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.62 
 
 		 237 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.87 
 
 		 234 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 252 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.63 
 
 		 267 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.45 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.28 
 
 		 236 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 253 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 253 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.54 
 
 		 234 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 253 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 253 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 253 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  42.13 
 
 		 252 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 240 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  50.28 
 
 		 252 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  42.13 
 
 		 252 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  50.54 
 
 		 240 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  52 
 
 		 232 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  52 
 
 		 236 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  49.44 
 
 		 233 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  49.44 
 
 		 233 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  50.28 
 
 		 259 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 252 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  46.92 
 
 		 244 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  47.67 
 
 		 254 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  51.41 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  46.73 
 
 		 241 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.41 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  46.45 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  48.7 
 
 		 242 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.93 
 
 		 237 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  50.83 
 
 		 238 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.47 
 
 		 240 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  44.44 
 
 		 244 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.28 
 
 		 236 aa  193  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  45.21 
 
 		 241 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 246 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.15 
 
 		 243 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  44.55 
 
 		 246 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.05 
 
 		 242 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.37 
 
 		 233 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.44 
 
 		 238 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.16 
 
 		 243 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  63.24 
 
 		 149 aa  189  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.21 
 
 		 231 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.31 
 
 		 243 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  47.92 
 
 		 242 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000133992  hitchhiker  0.00000148516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  45.88 
 
 		 245 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.24 
 
 		 242 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.72 
 
 		 235 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  45.21 
 
 		 247 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.28 
 
 		 234 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  48.95 
 
 		 246 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.24 
 
 		 239 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 244 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  48.94 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  47.92 
 
 		 245 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.21 
 
 		 242 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2111  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.21 
 
 		 242 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000449377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.31 
 
 		 240 aa  184  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 243 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.83 
 
 		 246 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 246 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 243 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  45.83 
 
 		 243 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 243 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 243 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 246 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  49.44 
 
 		 254 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.62 
 
 		 253 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  49.44 
 
 		 254 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  45.83 
 
 		 243 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  49.44 
 
 		 254 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.34 
 
 		 239 aa  183  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.59 
 
 		 235 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  62.77 
 
 		 154 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2838  DNA polymerase III subunit epsilon  46.52 
 
 		 244 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.85 
 
 		 238 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>