More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27831 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  68.9 
 
 		 247 aa  348  5e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  69.53 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  71.81 
 
 		 163 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  68.67 
 
 		 161 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  68.67 
 
 		 161 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02181  ribonuclease HI  43.03 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  42.86 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02291  ribonuclease HI  42.69 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.818783  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02201  ribonuclease HI  43.57 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137767  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0202  RNase HI  44.81 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  58.7 
 
 		 157 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  56.41 
 
 		 162 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  58.39 
 
 		 154 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  59.12 
 
 		 154 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  58.39 
 
 		 154 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  56.2 
 
 		 143 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  57.55 
 
 		 153 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  59.71 
 
 		 151 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  51.55 
 
 		 153 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  59.4 
 
 		 151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  35.79 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  54.48 
 
 		 149 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  59.4 
 
 		 151 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  56.39 
 
 		 147 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  52.94 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  56.93 
 
 		 150 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  56.52 
 
 		 145 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  53.47 
 
 		 146 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  54.74 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  53.96 
 
 		 150 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  51.8 
 
 		 150 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  56.39 
 
 		 146 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  56.39 
 
 		 148 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  53.62 
 
 		 148 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  53.62 
 
 		 148 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  52.52 
 
 		 150 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  56.39 
 
 		 148 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  54.01 
 
 		 146 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  54.89 
 
 		 147 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  55.07 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  52.63 
 
 		 235 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  52.41 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  54.89 
 
 		 147 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  54.89 
 
 		 147 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  55.07 
 
 		 157 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  52.52 
 
 		 157 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  54.14 
 
 		 147 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  54.14 
 
 		 147 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  54.14 
 
 		 147 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  55.4 
 
 		 161 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  51.01 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  55.4 
 
 		 150 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  53.24 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  56.93 
 
 		 154 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  53.62 
 
 		 151 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  51.45 
 
 		 150 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  52.9 
 
 		 148 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  50.72 
 
 		 149 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 163 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  35.34 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  52.11 
 
 		 146 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  48.91 
 
 		 147 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  53.62 
 
 		 160 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  53.38 
 
 		 152 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  55.4 
 
 		 157 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  52.55 
 
 		 147 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  54.14 
 
 		 141 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  50.72 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  54.74 
 
 		 153 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  53.62 
 
 		 153 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  50.34 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  51.82 
 
 		 150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  48.2 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  51.82 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  47.18 
 
 		 527 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  48.2 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  54.14 
 
 		 170 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  48.2 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  51.82 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  48.2 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  48.2 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  50.36 
 
 		 150 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.18 
 
 		 532 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  51.82 
 
 		 145 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50.36 
 
 		 148 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  50.72 
 
 		 148 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  48.55 
 
 		 148 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  49.66 
 
 		 147 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  50.36 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  54.14 
 
 		 154 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  52.55 
 
 		 153 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>