More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02201 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02201  ribonuclease HI  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137767  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02181  ribonuclease HI  89.5 
 
 		 239 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0202  RNase HI  90.76 
 
 		 239 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02291  ribonuclease HI  77.68 
 
 		 239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.818783  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  43.57 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  42.74 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  60.67 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2466  RNase HI  43.93 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  61.11 
 
 		 161 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  60.42 
 
 		 161 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  36.55 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  51.45 
 
 		 157 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  50 
 
 		 146 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  49.66 
 
 		 154 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  52.63 
 
 		 154 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  51.06 
 
 		 143 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  51.09 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  50.71 
 
 		 153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  50 
 
 		 151 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  49.66 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  53.28 
 
 		 145 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  51.88 
 
 		 153 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  49.64 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  52.63 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  51.82 
 
 		 148 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  51.09 
 
 		 149 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  50 
 
 		 150 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  50 
 
 		 150 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  45.07 
 
 		 214 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  51.13 
 
 		 151 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  51.88 
 
 		 154 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  49.64 
 
 		 153 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  51.08 
 
 		 157 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  50.36 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  49.64 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  49.64 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50.38 
 
 		 148 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  50.36 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  39.05 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  47.45 
 
 		 147 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  47.95 
 
 		 151 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50.38 
 
 		 148 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  50.36 
 
 		 149 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  50 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  47.18 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  51.09 
 
 		 154 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  51.08 
 
 		 157 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  48.91 
 
 		 152 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  49.64 
 
 		 157 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  48.55 
 
 		 148 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  44.83 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  48.87 
 
 		 153 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  47.45 
 
 		 150 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  51.88 
 
 		 145 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  45.83 
 
 		 148 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  49.62 
 
 		 153 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  46.62 
 
 		 163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  50.38 
 
 		 146 aa  129  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  44.16 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 154 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  51.13 
 
 		 146 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  48.18 
 
 		 155 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  47.83 
 
 		 153 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  48.87 
 
 		 150 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  48.12 
 
 		 160 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  44.74 
 
 		 149 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  43.51 
 
 		 154 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  46.81 
 
 		 157 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  47.41 
 
 		 161 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  46 
 
 		 148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  45.89 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  49.64 
 
 		 148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  46.53 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  47.41 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.91 
 
 		 146 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  48.61 
 
 		 147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.22 
 
 		 147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  47.83 
 
 		 150 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0428  ribonuclease H  34.47 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.91 
 
 		 148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.22 
 
 		 147 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  50 
 
 		 149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  43.4 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  47.86 
 
 		 147 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>