More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0263 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  85.62 
 
 		 146 aa  269  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  64.03 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  57.14 
 
 		 153 aa  183  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  59.44 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  56.74 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  60.71 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  62.04 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  58.57 
 
 		 154 aa  179  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  58.57 
 
 		 154 aa  179  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  60 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  59.29 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  58.7 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  56.34 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  56.03 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  56.52 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  56.72 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  56.03 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  57.14 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  57.25 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  55.32 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  55.8 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  59.42 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  59.42 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  56.74 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  55.32 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  55.32 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  54.29 
 
 		 154 aa  167  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  52.48 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  55.24 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  53.52 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  54.61 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  53.57 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  56.74 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  57.04 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  55.71 
 
 		 152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  53.1 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  57.58 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  55.48 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  56.93 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  57.97 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  56.52 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  54.74 
 
 		 164 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  54.93 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  56.2 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  53.47 
 
 		 153 aa  159  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  57.46 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  55.56 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  56.72 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  56.72 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  56.39 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  56.52 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  55.56 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  51.77 
 
 		 269 aa  158  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  50 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  54.01 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  53.57 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  54.48 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  49.32 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  55.63 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  54.48 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  51.43 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  55.47 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  51.43 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  55.15 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  54.35 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  48.92 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  51.41 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  51.43 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  54.41 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  52.14 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  53.68 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  51.05 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  53.68 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  53.24 
 
 		 164 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  55.15 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  51.43 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  52.94 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  49.32 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  54.29 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  51.75 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  52.55 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  54.01 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  53.33 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  52.14 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  54.81 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  49.29 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  51.39 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  52.82 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  53.33 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  53.33 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  52.17 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  54.2 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  52.9 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>