More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6005 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  68.54 
 
 		 223 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  67.28 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  63.64 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  63.64 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  64.41 
 
 		 225 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  70.92 
 
 		 143 aa  211  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  51.8 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  53.15 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  51.01 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  54.29 
 
 		 146 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  53.57 
 
 		 148 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  52.52 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  52.78 
 
 		 149 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  55.22 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  52.55 
 
 		 149 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  50.72 
 
 		 153 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  50.69 
 
 		 148 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  50 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  51.43 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  51.45 
 
 		 527 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  52.14 
 
 		 148 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  48.99 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  54.41 
 
 		 146 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  51.11 
 
 		 152 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  52.59 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4350  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4730  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4436  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  50.35 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  48.61 
 
 		 148 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1455  Ribonuclease H  45.81 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  51.85 
 
 		 147 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  50.71 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  50.71 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  48.94 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  46.41 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  48.91 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  43.93 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  49.67 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  51.11 
 
 		 147 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1836  ribonuclease H  46.81 
 
 		 151 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  51.11 
 
 		 147 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  49.32 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  51.11 
 
 		 147 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  46.98 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  48.23 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  51.11 
 
 		 147 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  51.85 
 
 		 151 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  51.11 
 
 		 147 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  49.64 
 
 		 145 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.91 
 
 		 532 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4905  ribonuclease H  48.23 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  49.65 
 
 		 148 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  51.11 
 
 		 145 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  49.65 
 
 		 148 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  49.28 
 
 		 148 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  49.28 
 
 		 148 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  47.52 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  50.35 
 
 		 155 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  49.65 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  48.95 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  50.37 
 
 		 148 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  50.37 
 
 		 148 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  47.52 
 
 		 151 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  49.29 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  52.14 
 
 		 150 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  50.37 
 
 		 151 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  45.77 
 
 		 143 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  49.63 
 
 		 148 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  48.32 
 
 		 157 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  48.15 
 
 		 163 aa  131  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  47.41 
 
 		 150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  46.48 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  47.86 
 
 		 148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  42.77 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  49.62 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  47.52 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1362  ribonuclease H  48.03 
 
 		 150 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  45.07 
 
 		 143 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  47.52 
 
 		 153 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  49.3 
 
 		 141 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  48.63 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1297  ribonuclease H  47.95 
 
 		 150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  46.48 
 
 		 150 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  49.66 
 
 		 157 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  45.77 
 
 		 161 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  49.65 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  49.65 
 
 		 155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  48.15 
 
 		 152 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>