254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3752 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  54.9 
 
 		 217 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  58.44 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  48.1 
 
 		 299 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 291 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  45.81 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 305 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  42.57 
 
 		 287 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  38.51 
 
 		 484 aa  101  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  38.51 
 
 		 475 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 335 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 292 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  46.25 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.87 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  36.54 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.36 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  37.96 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 235 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  41.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  27.66 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  34.33 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  30.5 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 234 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  32.26 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  32.29 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.31 
 
 		 317 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  35.44 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  35.44 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  35.44 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  35.85 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  35.44 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  35.85 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  31.45 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  38.64 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  34.18 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  38.16 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  40 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  39.29 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  31.45 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.29 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 542 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>