86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2848 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  90.22 
 
 
184 aa  326  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  89.67 
 
 
184 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  89.67 
 
 
184 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  89.67 
 
 
184 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  89.67 
 
 
184 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  88.33 
 
 
180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  81.36 
 
 
185 aa  305  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  79.66 
 
 
216 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  79.66 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  79.44 
 
 
203 aa  283  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  75.13 
 
 
201 aa  279  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  77.9 
 
 
182 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  77.9 
 
 
182 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  77.9 
 
 
182 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  41.67 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  41.67 
 
 
178 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
177 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  39.18 
 
 
180 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
178 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
178 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
177 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
177 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
178 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
185 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  35.87 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
197 aa  91.3  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
178 aa  90.9  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 
169 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.74 
 
 
459 aa  89.4  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.65 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  35.29 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.6 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.25 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.95 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  29.21 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.12 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
277 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
178 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
277 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.58 
 
 
255 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  27.5 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
283 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 
331 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.08 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.53 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.3 
 
 
216 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5046  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
273 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.88 
 
 
197 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
322 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.53 
 
 
227 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
134 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  24.2 
 
 
451 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  31.76 
 
 
182 aa  41.2  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  26.62 
 
 
174 aa  41.2  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.21 
 
 
213 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>