113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3389 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 197 aa  95.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  37.25 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  36.48 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  35.44 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  30.52 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  35.44 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  34.81 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  34.81 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  34.81 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  34.81 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.72 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.45 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.53 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.43 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.93 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.36 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  28.41 
 
 		 451 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.13 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  30.77 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.39 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  28.46 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.03 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.11 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.58 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  22.58 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.91 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.83 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.95 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  25.78 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.68 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.92 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 301 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 277 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 319 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  27.34 
 
 		 303 aa  44.3  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  21.66 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.16 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.77 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 322 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  25.77 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.77 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.12 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  28.79 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.77 
 
 		 182 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 318 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.38 
 
 		 216 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.77 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 277 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.77 
 
 		 182 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  20.36 
 
 		 203 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  25 
 
 		 308 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.77 
 
 		 182 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 314 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.2 
 
 		 190 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  27.55 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 315 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.963277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>