97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1436 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  86.93 
 
 		 185 aa  316  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  79.55 
 
 		 184 aa  295  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  80.66 
 
 		 216 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  80.66 
 
 		 216 aa  285  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  84.18 
 
 		 203 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  84.12 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  83.43 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  83.43 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  83.43 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  83.43 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  81.5 
 
 		 184 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  79.65 
 
 		 180 aa  270  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  45.51 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  44.31 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 		 180 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 178 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 		 459 aa  99.8  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  37.04 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  37.5 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.33 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  36.13 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.81 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.53 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.24 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.28 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.78 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.75 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 331 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.16 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  34.88 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  23.73 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.2 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.21 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.46 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  30.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 277 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  28.67 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.57 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  25.98 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  27.42 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.68 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  28.33 
 
 		 255 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1919  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.68 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.353354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 273 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 273 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  26.05 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.27 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  23.36 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.12 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>