64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7007 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  100 
 
 		 184 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  35.87 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  35.87 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  35.87 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  35.87 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  35.87 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  37.04 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  37.04 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  29.67 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.41 
 
 		 459 aa  67  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  30.12 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  28.73 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  28.73 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  34.07 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  30.3 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  36.84 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 331 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  36.49 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  31.25 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  35.44 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  35.44 
 
 		 322 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 147 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 189 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  40 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>