86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2587 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  99.46 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  89.67 
 
 		 184 aa  342  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  92.78 
 
 		 180 aa  324  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  84.57 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  82.08 
 
 		 216 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  82.08 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  81.92 
 
 		 201 aa  283  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  84.12 
 
 		 203 aa  283  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  83.43 
 
 		 182 aa  277  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  83.43 
 
 		 182 aa  277  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  83.43 
 
 		 182 aa  277  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  40.72 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  40.12 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  35.87 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.16 
 
 		 459 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 169 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 170 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.01 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.86 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.67 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.5 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  30.97 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  35.66 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.7 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.89 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.12 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 277 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  29.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.15 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.73 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 273 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  25.52 
 
 		 331 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 273 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.33 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.35 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.44 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  26.61 
 
 		 451 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.97 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 322 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 156 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 240 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  26.56 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  47.17 
 
 		 314 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.78 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.29 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>