42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4113 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  93.03 
 
 
287 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  86.48 
 
 
282 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  71.43 
 
 
283 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 
288 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 
288 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  69.96 
 
 
285 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  67.48 
 
 
288 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  67.48 
 
 
288 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  67.84 
 
 
285 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  67.49 
 
 
285 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  69.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  69.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  69.64 
 
 
285 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  69.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  69.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  69.64 
 
 
285 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  69.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 
284 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  47.84 
 
 
267 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
283 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
280 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  36.4 
 
 
285 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  37.45 
 
 
292 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  46.67 
 
 
192 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  34.2 
 
 
299 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  35.11 
 
 
316 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  38.22 
 
 
229 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
277 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
277 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  33.19 
 
 
319 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 
232 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 
357 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
283 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>