66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2739 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  96.7 
 
 
273 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  59.22 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  55.96 
 
 
322 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 
283 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  50.58 
 
 
272 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
277 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
277 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  36.36 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  34.97 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  34.25 
 
 
319 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  36.98 
 
 
280 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  33.85 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.87 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  33 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  34.36 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  34 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  29.44 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 
357 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  25.14 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  33.64 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  27.86 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
170 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  35.56 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
181 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  34.55 
 
 
180 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
177 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
185 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  29.32 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  26.67 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
177 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
177 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 
459 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  40.28 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  32.95 
 
 
177 aa  46.6  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  34.29 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
178 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
182 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  37.29 
 
 
145 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>