More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1279 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 493 aa  952    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  74.41 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  74.14 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  62.99 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  61.89 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.39 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 413 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  38.1 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  32.19 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 392 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  32.53 
 
 		 412 aa  136  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 413 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  32.78 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  32.78 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  32.78 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  32.78 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  32.78 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  32.78 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  32.78 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  28.54 
 
 		 415 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  35.34 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.39 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 415 aa  97.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 390 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  29.87 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  29.87 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  21.38 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25.33 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.33 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  30.94 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.15 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  26.44 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.3 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  29.56 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25.34 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25.34 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.25 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.8 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  35.42 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>