More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2933 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
351 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.24 
 
 
311 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
309 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.75 
 
 
301 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 
301 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 
301 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 
301 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
310 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 
301 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.85 
 
 
301 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  49.55 
 
 
301 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 
304 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 
301 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
301 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
301 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  47.69 
 
 
293 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  47.73 
 
 
291 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  43.54 
 
 
292 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
295 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
292 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
298 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
333 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
300 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.72 
 
 
316 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
307 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
292 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
305 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.92 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.92 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.23 
 
 
306 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
913 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.06 
 
 
298 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
303 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
305 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.69 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.02 
 
 
306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
296 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  40.34 
 
 
303 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
306 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  40.34 
 
 
303 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
309 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
303 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
287 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 
307 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
306 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  36.88 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
287 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
303 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
303 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 
301 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
309 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
301 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
304 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.04 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
710 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
302 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
313 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
305 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
305 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
313 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
302 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
304 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.43 
 
 
304 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
305 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  38.59 
 
 
292 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  36.48 
 
 
304 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  32.79 
 
 
901 aa  159  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.91 
 
 
286 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
301 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.43 
 
 
304 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  37.46 
 
 
305 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
315 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
301 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
302 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
304 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
308 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.76 
 
 
317 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  41.08 
 
 
903 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  39.44 
 
 
350 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
326 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>