18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2944 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2944  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.234718  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.82 
 
 
848 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.93 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  85 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  82.93 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  82.93 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.49 
 
 
527 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  49.49 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  56.45 
 
 
628 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  78.05 
 
 
149 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  77.5 
 
 
361 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0904  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
197 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  78.57 
 
 
828 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  76.32 
 
 
318 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  82.76 
 
 
365 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3533  ABC transporter related  77.78 
 
 
522 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  78.57 
 
 
332 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  78.57 
 
 
731 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>