More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4778 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  78.38 
 
 		 496 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  77.56 
 
 		 479 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  80.34 
 
 		 493 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 628 aa  1229    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  77.67 
 
 		 492 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  73.38 
 
 		 485 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  74.02 
 
 		 494 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  70.55 
 
 		 507 aa  601  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  72.66 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  67.14 
 
 		 508 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  66.9 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  59.05 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  55.99 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  47.91 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.58 
 
 		 506 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  47.72 
 
 		 521 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.58 
 
 		 506 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.35 
 
 		 506 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  47.79 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 513 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 506 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  47.6 
 
 		 575 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  48.54 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  44.02 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  45.97 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  46.85 
 
 		 551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.27 
 
 		 513 aa  313  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.4 
 
 		 514 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.23 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  47.46 
 
 		 509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  42.82 
 
 		 797 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.28 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.76 
 
 		 503 aa  310  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  45.74 
 
 		 484 aa  310  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  42.07 
 
 		 488 aa  310  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  46.92 
 
 		 511 aa  309  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  47.43 
 
 		 491 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  46.02 
 
 		 863 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  45.37 
 
 		 490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  43.22 
 
 		 515 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  43.45 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  41.16 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  47.29 
 
 		 490 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  43.78 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  42.65 
 
 		 514 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.72 
 
 		 858 aa  303  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 864 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.65 
 
 		 491 aa  302  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 491 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 511 aa  300  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.07 
 
 		 487 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  42.58 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  44.87 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  38.65 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.77 
 
 		 852 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.16 
 
 		 489 aa  298  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.67 
 
 		 496 aa  297  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.62 
 
 		 491 aa  297  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  37.32 
 
 		 487 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  48.1 
 
 		 501 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  39.52 
 
 		 492 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  42.52 
 
 		 529 aa  296  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 484 aa  296  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.39 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  44.66 
 
 		 483 aa  294  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  44.5 
 
 		 490 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  43.13 
 
 		 495 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  47 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.69 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  41.88 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.25 
 
 		 787 aa  291  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  42.74 
 
 		 561 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.49 
 
 		 518 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  41.42 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.65 
 
 		 489 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  42.45 
 
 		 495 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  42.45 
 
 		 495 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  42.82 
 
 		 517 aa  290  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 495 aa  290  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 485 aa  289  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  44.18 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  43.64 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  42.73 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  42.44 
 
 		 495 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.34 
 
 		 863 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  39.95 
 
 		 565 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.77 
 
 		 485 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 486 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  41.61 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.37 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  46.12 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.83 
 
 		 507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  42.45 
 
 		 954 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  43.26 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>