More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2565 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  75.88 
 
 		 492 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2529  cobyric acid synthase CobQ  76.47 
 
 		 496 aa  717    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  77.27 
 
 		 493 aa  715    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  77.56 
 
 		 628 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  75.86 
 
 		 494 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  75.75 
 
 		 507 aa  756    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 479 aa  963    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  78.14 
 
 		 485 aa  768    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2304  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  66.6 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016218  normal  0.711667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2806  cobyric acid synthase CobQ  67.79 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563114  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2661  cobyric acid synthase CobQ  63.6 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0518  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  57.17 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00186499  normal  0.0297746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  52.33 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  46.41 
 
 		 509 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.42 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.42 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.06 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  46.22 
 
 		 521 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.98 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.98 
 
 		 513 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  40.04 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.07 
 
 		 491 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.04 
 
 		 513 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.95 
 
 		 503 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  43.88 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.5 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.48 
 
 		 503 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  48.99 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.08 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.86 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  44.18 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.1 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  44.76 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.14 
 
 		 864 aa  333  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  41.65 
 
 		 495 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  41.56 
 
 		 858 aa  332  7.000000000000001e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  41.65 
 
 		 495 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  40.79 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  40.22 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  48.65 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.11 
 
 		 490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  39.65 
 
 		 560 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  40.08 
 
 		 797 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  42.19 
 
 		 491 aa  329  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  46.09 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.49 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.6 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.17 
 
 		 852 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  39.84 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  39.18 
 
 		 534 aa  326  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  43.5 
 
 		 527 aa  326  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  39.15 
 
 		 526 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.52 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  39.88 
 
 		 514 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  39.65 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.64 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  50.86 
 
 		 501 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.34 
 
 		 484 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 512 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  39.03 
 
 		 565 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.6 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  43.97 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  39.77 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  45.54 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  43.97 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  39.8 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.37 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.26 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 484 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.2 
 
 		 863 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  47.89 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  40.44 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  38.16 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  42.57 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.1 
 
 		 863 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  42.48 
 
 		 954 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  40.94 
 
 		 484 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  38.33 
 
 		 541 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  43.26 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  48.88 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  32.93 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  42.98 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  38.83 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  38.13 
 
 		 541 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.5 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>