256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2864 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  100 
 
 		 551 aa  1086    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  63.44 
 
 		 539 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  64.23 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  56.37 
 
 		 852 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  54.39 
 
 		 864 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  53.35 
 
 		 863 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  56.63 
 
 		 561 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  54.12 
 
 		 863 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 		 858 aa  472  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  47.15 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 506 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 506 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.04 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  46.07 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.49 
 
 		 797 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  44.18 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  44.36 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  49.3 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.07 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  44.53 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  47.27 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  47.31 
 
 		 508 aa  389  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  39.67 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.14 
 
 		 772 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.04 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.38 
 
 		 787 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  44.01 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.81 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.63 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  43.82 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  46.08 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  45.95 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  47.79 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  42.29 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.48 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  42.57 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  42.29 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.82 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  44.02 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  44.91 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.88 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.15 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  48.01 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  41.84 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.05 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.83 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  47.37 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  47.35 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.59 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.98 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41.78 
 
 		 491 aa  362  8e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.68 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  44.67 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  41.65 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  44.85 
 
 		 495 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.37 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.49 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  37.66 
 
 		 487 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.85 
 
 		 487 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  39.47 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  40.11 
 
 		 560 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 505 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.25 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  39.27 
 
 		 536 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.82 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  44.02 
 
 		 481 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  45.55 
 
 		 504 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  40.11 
 
 		 485 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  43.83 
 
 		 481 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.7 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  39.57 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  38.74 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  39.09 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  43.73 
 
 		 484 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.89 
 
 		 486 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.37 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  43.98 
 
 		 486 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.48 
 
 		 487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  43.02 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.07 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  39.16 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  39.89 
 
 		 534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  41.05 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  38.6 
 
 		 541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.17 
 
 		 512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  45.89 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  45.07 
 
 		 486 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.07 
 
 		 565 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  43.06 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  40.15 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>