More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1848 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 496 aa  982    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  50.99 
 
 		 517 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.61 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.13 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  44.53 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.43 
 
 		 776 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  45.54 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  44.14 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  46.05 
 
 		 489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.27 
 
 		 787 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  49.19 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.34 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  47.09 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.6 
 
 		 772 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  46.76 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  45.91 
 
 		 864 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.22 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  47.27 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.02 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  45.22 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.22 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  47.43 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.12 
 
 		 797 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  44.16 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.17 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  48.65 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  50.1 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  46.57 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  45.23 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  51.32 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  46.89 
 
 		 490 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  46.48 
 
 		 529 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.16 
 
 		 491 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  43.32 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  43.32 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  46.29 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  50.2 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  42.52 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.89 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  48.1 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  45.66 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  42.38 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.53 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  47.09 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  47.46 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 		 863 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.58 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40.04 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  43.98 
 
 		 534 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 518 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.6 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.71 
 
 		 863 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  50.1 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  45.01 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.4 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  47.44 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  47.24 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  48.89 
 
 		 575 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  46.03 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  47.04 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47.9 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.4 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  44.87 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  42.19 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 565 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.81 
 
 		 858 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.95 
 
 		 526 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  44.76 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  43.73 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  43.49 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.33 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.33 
 
 		 777 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  48.49 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  48.59 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  44.71 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 535 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  48.48 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  48.7 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 523 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 529 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  47.76 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.4 
 
 		 475 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.55 
 
 		 852 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  47.99 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  43.7 
 
 		 527 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>