More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0181 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 
494 aa  990    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  49.41 
 
 
515 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  50.61 
 
 
491 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  47.25 
 
 
503 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  49.9 
 
 
491 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  50.71 
 
 
502 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  47.45 
 
 
506 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.86 
 
 
503 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  49.41 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  49.6 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  47.54 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  46.81 
 
 
495 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  47.01 
 
 
503 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  47.9 
 
 
495 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  46.81 
 
 
495 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  45.62 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  45.19 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  46.15 
 
 
513 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  46.05 
 
 
506 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.12 
 
 
494 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.96 
 
 
506 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  46.15 
 
 
506 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  46.31 
 
 
864 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  47.84 
 
 
491 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  46.15 
 
 
506 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  49 
 
 
863 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  48.19 
 
 
863 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  48.23 
 
 
508 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
485 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  44.66 
 
 
513 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.71 
 
 
797 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  46.91 
 
 
514 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  51.45 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  46.83 
 
 
485 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  51.24 
 
 
490 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  48.5 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  49.69 
 
 
484 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  46.41 
 
 
475 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.18 
 
 
500 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  47.76 
 
 
484 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  51.03 
 
 
486 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
486 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.62 
 
 
787 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  50.21 
 
 
484 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  47.14 
 
 
489 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  49.79 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  49.4 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  49.38 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.4 
 
 
776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  49.09 
 
 
505 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  43.56 
 
 
514 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
483 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.76 
 
 
493 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  45.01 
 
 
539 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.73 
 
 
772 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  46.99 
 
 
534 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.75 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  43.22 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  45.83 
 
 
532 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  47.98 
 
 
481 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.96 
 
 
858 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.96 
 
 
496 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  45.9 
 
 
541 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  46.29 
 
 
541 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  48.99 
 
 
495 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  48.25 
 
 
487 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  46.65 
 
 
518 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  43.31 
 
 
500 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  45.23 
 
 
485 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  41.27 
 
 
509 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  44.59 
 
 
536 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  42.36 
 
 
487 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  45.9 
 
 
541 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  48.62 
 
 
509 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  45.24 
 
 
560 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  47.33 
 
 
481 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  45.52 
 
 
565 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  47.19 
 
 
504 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.96 
 
 
487 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.7 
 
 
510 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 
777 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  43.75 
 
 
485 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  47.48 
 
 
486 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  46.33 
 
 
495 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  43.7 
 
 
511 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  44.18 
 
 
496 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  48.17 
 
 
496 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  45.28 
 
 
556 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  47.12 
 
 
481 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  45.02 
 
 
526 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  40.6 
 
 
494 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  46.14 
 
 
485 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  45 
 
 
551 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  41.35 
 
 
509 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.96 
 
 
852 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  46.41 
 
 
480 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  48.31 
 
 
511 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  48.38 
 
 
500 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  40.59 
 
 
510 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  44.62 
 
 
534 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>