More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2453 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  99.17 
 
 
481 aa  946    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  69.89 
 
 
481 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  91.89 
 
 
481 aa  862    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  100 
 
 
481 aa  952    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  69.44 
 
 
477 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  62.79 
 
 
493 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  66.11 
 
 
500 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  66.11 
 
 
494 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  65.07 
 
 
494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  65.62 
 
 
480 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  65.2 
 
 
482 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  65.42 
 
 
488 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  64.03 
 
 
495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  64.86 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  62.19 
 
 
485 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  60.33 
 
 
480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  64.64 
 
 
485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  64.06 
 
 
489 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  65.83 
 
 
484 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  60.21 
 
 
483 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  59.79 
 
 
488 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2096  cobyric acid synthase  62 
 
 
486 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  59.29 
 
 
483 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  59.79 
 
 
506 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  59.38 
 
 
484 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  62.18 
 
 
496 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  57.53 
 
 
488 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  60.33 
 
 
491 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  59.02 
 
 
484 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  59.79 
 
 
484 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  60.71 
 
 
492 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  60.04 
 
 
485 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  58.92 
 
 
492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  56.77 
 
 
516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  58.14 
 
 
486 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  55.88 
 
 
524 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  55.44 
 
 
525 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3564  cobyric acid synthase  57.74 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0326183  normal  0.13415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  53.91 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  54.43 
 
 
525 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  58.24 
 
 
484 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  58.46 
 
 
488 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3550  cobyric acid synthase  54.29 
 
 
513 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  53.38 
 
 
483 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.46 
 
 
500 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  54.2 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  50.31 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  54.81 
 
 
495 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  53.29 
 
 
495 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  51.57 
 
 
511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  50.1 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  50.2 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  52.26 
 
 
504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.79 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  50.72 
 
 
484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  51.34 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  50.41 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  49.69 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  53.04 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  47.4 
 
 
485 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  53.32 
 
 
505 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  51.46 
 
 
484 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  51.04 
 
 
490 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  51.34 
 
 
486 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  49.58 
 
 
486 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  48.22 
 
 
483 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  50.42 
 
 
490 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  49.79 
 
 
486 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  50.62 
 
 
488 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  45.83 
 
 
485 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  47.17 
 
 
475 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
529 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
512 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  52.28 
 
 
585 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
545 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  51.83 
 
 
511 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
531 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  51.83 
 
 
511 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  52.28 
 
 
535 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  52.07 
 
 
523 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  50.91 
 
 
501 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  51.32 
 
 
511 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  51.02 
 
 
500 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  50.81 
 
 
504 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  51.35 
 
 
520 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.42 
 
 
787 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  47.07 
 
 
534 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  50.81 
 
 
500 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.76 
 
 
484 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  47.21 
 
 
560 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  45.88 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  51.97 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  49.9 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  47.47 
 
 
534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  46.31 
 
 
556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  46.37 
 
 
541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  46.5 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  46.14 
 
 
534 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  45.54 
 
 
523 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  45.91 
 
 
565 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>